合金装备 （另一篇）

忽然梅丽尔（Meryl）的脑袋剧烈的疼痛起来。她慢慢拔出了腰间的手枪再次对准了Snake。这时无线接收器响起。Campbell告诉你，梅丽尔已经被所长所控制，现在的她已不能 控制自己的思维了，但是就是如此，你也不能 对她攻击。不过有一样武器可以让她昏迷……Snake快速 向梅丽尔投掷了一颗昏迷弹（STUN.G），梅丽尔倒下了。现在你可以放心对付所长了，可是他却运用 意念随意地控制着室内的物体，让它们向你发起攻击。注意 躲避那些东西，看准时机对所长扫射。激战了一会，昏迷的梅丽尔醒了过来，可是这次她的枪却对准了自己的脑袋。再次投掷昏迷弹后，再和处长展开最后的搏斗。可是所长他现在隐身了。站在原地等待他的出现后，一边躲开他控制的那些飞行物，一边对他猛烈射击。不久后，所长终于给击毙，倒在了地上。这时你的KEYCARD也升级为LV.5。从所长室右上方门出去，检拾起楼梯边的一些武器子弹后，进入一个伸手不见五指的黑暗洞窟。
顺着走道前行，这里有一个岔道，一个是铺满白雪的道路，一个是继续向前的石道，顺着石道前进，在那里Snake通过一个大窟窿看见了在外面等候的梅丽尔（Meryl），不过从这里你并不能 直接通过，检拾起在那的道具（补血剂（Ration）和子弹后，返回石道来到白雪地，下蹲后，爬行通过那里的小洞。这时只见黑糊糊的山洞中，有着一些恶狼徘徊着，突然它们发觉 Snake后，向他发起了攻击。由于山洞中十分黑暗，Snake佩带上了夜视镜，将那些恶狼干掉后。绕向右下方爬进另一个山洞。一路上还有些恶狼，你要注意 对付了，爬出后再往右走，爬出那里，忽然眼前一亮，看见了在此等候多时的梅丽尔了。
梅丽尔带着Snake进入地下通路，这时只见梅丽尔中枪倒在了地上，原来在前方的走道上有一个阻击手……。这时无线接收器响起，Campbell告诉Snake，要对付这个阻击手必须拿到战车格纳库地下“B2武器库”层中阻击枪（PSG1）。立刻后退，穿过山洞，来到所长室，出门乘电梯来到1F后，出大门，来到雪地。这时外面的雪地中有了监视器，注意 绕过它们，留心 雪地中埋着的地雷。经过一段周折，终于返回到了战车格纳库的地下“B2武器库”层。装备上LV.5通行卡后，进入最左上方的门内。不过安放阻击枪（PSG1）和少数弹药的地点 外有红外线侦测，带上红外线夜视镜后，注意 匍匐绕过那些立体交叉的红外线，取到阻击枪。火速返回“地下通路”，去和敌人的阻击手对决。
先服用一粒精神安定剂（Diazepam），这样在你瞄准时才不至于手握阻击枪的手发抖而瞄不准敌人。当躲在角落里的Snake通过不断移动及瞄准射击战胜了阻击手后（若找不到敌人，阻击枪可搭配红外线夜视镜运用 ），Snake来到了右上方的电梯口，这时警报响起。两个敌人和先前那个阻击手举枪对准了Snake，手中的枪被强迫地扔在了地上，忽然Snake的脑袋上被枪柄重重地敲击了一下。Snake被敌人抓住了……

在医疗室里，Snake被绑在了电击平台上。同时这里也开始了剧情的分歧（若挑选 还原 体力，最终将是和梅丽尔（Meryl）一起离开基地<通关后得到无限弹药道具：梅丽尔的绣花手帕>；若挑选 放弃，则最终和科学家一起离开，梅丽尔（Meryl）死亡〈通关后得到隐身道具：迷彩〉）！